Konferencja Naukowa Studentów » 2004 » Chemia
Strony: « 1 | 2 | 3 |

Superkomputer czy domowy PC? Do czego chemik potrzebuje komputera cd.

Sobota, 14 marca

2. ILUSTRACJE


Rys. 1. Schemat energetyczny różnicowej stabilizacji stanu przejściowego


Rys. 2. Kompleks substratów (cytozyna + woda, lewa strona) oraz stan przejściowy (prawa strona) wewnątrz siatki reprezentującej wnętrze centrum aktywnego. Obie cząsteczki generują silny potencjał dodatni w wyniku protonacji pierścienia cytozyny. Wartość potencjału elektrostatycznego zgodna z przedstawioną skalą (w jednostkach atomowych), wektory pola reprezentowane są długościami stożków.


Rys. 3. Idealne środowisko katalityczne – różnica potencjałów i pól dla stanu przejściowego i kompleksu substratów (lewa strona) oraz komplementarne własności centrum aktywnego (prawa strona).

Autor: Paweł WIELGUS

LITERATURA

[1] HUMPHREY W., DALKE A., SCHULTEN K., J. Molec. Graphics 1996, 14, 33–38.
[2] KĘDZIERSKI P., SOKALSKI W.A., J. Comp. Chem. 2001, 20(10), 1082–1097.
[3] KĘDZIERSKI P., SOKALSKI W.A., KRAUSS, M., J. Comp. Chem. 2000, 21(6), 432–445.
[4] KĘDZIERSKI P., WIELGUS, P., SIKORA, A., SOKALSKI W.A., LESZCZYŃSKI J. Int. J. Mol. Sci. 2004, 1, 1–10.
[5] MOROKUMA K., MUSAEV D.G., VREVEN T., BASCH H., TORRENT M., KHOROSHUN D. IBM J. Res. & Dev. vol.45 no. 3/4 5/6 2001.
[6] REIN R., Adv. Quantum Chem. 1973, 7, 335–397.
[7] SOKALSKI W.A, J. Mol. Catal. 1985, 30(3), 395–410.
[8] SOKALSKI W.A., KĘDZIERSKI P., GREMBECKA J., DZIEKOŃSKI P., STRASBURGER K. Comp. Mol. Biol. Leszczynski., Ed., Elsevier–Science: New York, 1999, vol. 8, 369–396.
[9] SOKALSKI W.A., POIRIER R. A., Chem. Phys. Lett. 1983, 98(1), 86–92.
[10] WIELGUS, P. Praca Dyplomowa, Wydział Chemiczny Politechniki Wrocławskiej, 2004.

Czytaj dalej

Artykuły z tej samej kategorii
1. Modelowanie molekularne homodimeru białka ECR
2. Usuwanie n-butanolu z roztworów wodnych
3. Dehydratacja uwodnionych kryształów siarczanu (vi) miedzi (ii) w polu mikrofal
4. Projektowanie nowych białek o zadanych właściwościach katalitycznych

powrót »

Kategorie


projekt i wykonanie: smetek.biz